Si tout se passe comme il faut lors de la formation des gamètes, il y a toujours au moins un chiasma. Mais la fréquence de recombinaison entre les deux chromosome homologues varie en fonction de l’espèce, du sexe, de la taille du chromosome et certainement d’autres facteurs. Chez les humains, il y a en moyenne 1.6 recombinaisons par chromosome (1.2 recombinaisons par mégabase d’ADN). Il y a globalement plus d’évènements de recombinaison chez les femmes que chez les hommes. Chez d’autres espèces, la fréquence peut être très différente; par exemple chez les micro-organismes et champignons, la fréquence est beaucoup plus élevée. Dans de rares cas, il peut arriver qu’il n’y ait pas de chiasma qui se forme, cela peut alors causer des problèmes lors de la séparation des chromosomes, comme des aneuploïdies.