Il arrive que des bactéries parviennent à remonter du méat urinaire (l’orifice externe de l’urètre) jusqu’aux reins et, en se multipliant, provoquent une infection. Ces bactéries peuvent par exemple produire des toxines et détruire des tissus. Le corps va se défendre et tenter de détruire les bactéries, mais si leur nombre est trop élevé, ou si elles sont très agressives, il faudra l’aider en administrant des antibiotiques. L’exemple typique est celui d’une pyélonéphrite (infection d’un rein) due à une bactérie appelée Escherichia Coli. Cette bactérie est normalement présente dans l’intestin où elle est nécessaire à son bon fonctionnement. Mais, si elle est transportée (par exemple par la transpiration) jusqu’au méat urinaire, chez les femmes, elle peut parfois remonter les voies urinaires et provoquer une cystite, puis se propager jusqu’à un rein et provoquer une infection rénale.