En général, quand les condylomes sont traités, cela aide le corps à combattre le virus. C'est-à-dire que le traitement renforce le système immunitaire, qui pourra ensuite mieux combattre le virus. On n’est pas certain de s’il persiste dans les régions génitales, mais il est hautement probable qu'il peut devenir inactif et ensuite se réactiver.

Les connaissances médicales actuelles n'ont jamais démontré le fait qu'un virus pouvait muter : une souche 33 reste 33, une souche 16 reste 16.